More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2520 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 117 aa  242  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  58.77 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  55.26 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  54.39 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  54.37 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  53.92 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  52.94 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  54.46 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  50.96 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  52.04 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  47.57 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  50.49 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 116 aa  103  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  49.53 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  47.57 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 115 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  48.98 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  48.48 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  40.87 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 125 aa  95.9  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  46.08 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  46.74 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  48.35 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 122 aa  87.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  39.36 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  39.36 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  46.46 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  35.51 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  45.98 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  37 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  37 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  37 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  39.05 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  37 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  45.98 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  47.13 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  37 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  45.16 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  42.71 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  42.22 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  42.22 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  42.71 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  41 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  37 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  44.94 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  41.11 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  41.76 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  45.56 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>