More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3323 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 123 aa  253  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  58.77 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  59.05 
 
 		 118 aa  136  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  60.19 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  60 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  57.55 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  57.01 
 
 		 113 aa  124  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  54.21 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  55.66 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  47.86 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  52.78 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  53.1 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  49.52 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  48 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  48.54 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  46.9 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  46.73 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  43.64 
 
 		 127 aa  100  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  42.99 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  40.68 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  45.13 
 
 		 114 aa  94.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  42.99 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  46.55 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  35.54 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 131 aa  88.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 156 aa  87  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  39.36 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  39.36 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  40.43 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  40.43 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  40.43 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3325  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196974  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  42.71 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  39.36 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  40.91 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  38.3 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  45.74 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  38.3 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  41.3 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  40.66 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  36.54 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  43.68 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  43.68 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  41.44 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  40.37 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  45.56 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  38.3 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  38.3 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>