More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3126 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 122 aa  250  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  57.02 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  58.93 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  59.29 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  50.44 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 123 aa  110  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  43.7 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  44.14 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  43.36 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 128 aa  93.6  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  40.5 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 114 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  40.37 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  37.5 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  38 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  36 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  35.4 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  42.39 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  36 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  36 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  34.23 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  35 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  35 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  40.66 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  37.29 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  32.43 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0113  HxlR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  37.11 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  37.11 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  41.76 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  38.3 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  38.14 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  40.66 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  38.14 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  38.14 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2498  HxlR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  40.66 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  38.14 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  35.34 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  36.11 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5876  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal  0.496551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>