More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3989 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  256  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  46.02 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  44.74 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  43.36 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  46.22 
 
 		 117 aa  95.9  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  42.59 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  41.96 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  39.2 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  42.48 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  41.59 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  38.53 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 123 aa  87.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  41.82 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  38.18 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  39.37 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  36.07 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  40.45 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  39.6 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  38 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  38 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  38 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  38 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  38 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  38 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  38 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  38.95 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  39.45 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  38.95 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  33.06 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  38.95 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  38.78 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  37 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  39.8 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  37.76 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  37 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  37 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  37 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  39.33 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  39.8 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1752  hypothetical protein  37.93 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0613542  normal  0.0473163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  38.32 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  39.8 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  37.89 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  35.92 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0518  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  34.51 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  36.89 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  40.4 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  34.55 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>