More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0160 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 130 aa  263  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  48.48 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  49 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  43.4 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  46.81 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  41.18 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  44.21 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  44.21 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  37.14 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  39.05 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  36.19 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  36.19 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  44.21 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  44.21 
 
 		 114 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  42.31 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  41.03 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  41.38 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  42.11 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  42.11 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  42.11 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  40.18 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  39.36 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  43 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  42.11 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  42.11 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  42.11 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  42.11 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  43 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  39.05 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  44.21 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  44.21 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  44.21 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  44.21 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  44.21 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3750  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 123 aa  76.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  42.11 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  42.11 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  37.84 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  43.16 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  43.16 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  42.55 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  40.78 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  43.16 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  41.49 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  41.49 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  41.49 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  41.49 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  41.49 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  41.49 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  42.11 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3957  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>