More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0247 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  263  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  47.58 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  45.22 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  45.05 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  51.09 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  47.42 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  47.42 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  47.42 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  47.42 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  47.92 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  48.45 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  43.69 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  43.69 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  50.53 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  48.15 
 
 		 206 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  43.69 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  46.32 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  43.69 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  48.15 
 
 		 220 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  50.53 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  50.53 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  50.53 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  50.53 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  50.98 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  51.09 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  49.48 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  48.96 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  48.96 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  48.96 
 
 		 126 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  48.96 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  48.96 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  48.96 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  48.45 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  48.96 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  47.87 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3041  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  50.53 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  45.36 
 
 		 114 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0892  HxlR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 215 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  45.36 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  45.36 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 151 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2009  transcriptional regulator  48.91 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  47.57 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  47.57 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  44.33 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  44.33 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  44.33 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  44.33 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  44.33 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  44.33 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  42.55 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  45.05 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  42.11 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>