More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2087 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  239  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3957  HxlR family transcriptional regulator  62.83 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  61.26 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1349  transcriptional regulator, HxlR family  56.64 
 
 		 128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  45.79 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  47.57 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  51.06 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  43.86 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  49.48 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  49.48 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  49.48 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  49.48 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  49.48 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 106 aa  100  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  49.48 
 
 		 220 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  49.46 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  49.48 
 
 		 206 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  48.39 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  48.39 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 111 aa  98.6  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  48.39 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  48.39 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  48.39 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  44.64 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  43.48 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4987  transcriptional regulator, HxlR family  40.35 
 
 		 125 aa  95.9  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  43.43 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 		 134 aa  95.1  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 120 aa  95.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  44.66 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  42.27 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  42.27 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  94  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  42.71 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  41.23 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  93.6  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  46.67 
 
 		 114 aa  93.6  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  46.67 
 
 		 114 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  93.6  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 115 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  42 
 
 		 119 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  40.38 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  47.78 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  45.74 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0337  transcriptional regulator  47.25 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  43.75 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  40.62 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  51.72 
 
 		 112 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>