More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2009 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_2009  transcriptional regulator  100 
 
 		 95 aa  191  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  74.44 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  64.13 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  64.13 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  63.04 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  63.04 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  63.04 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  63.04 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  63.04 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  63.04 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  63.04 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  63.04 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  61.96 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  63.04 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  65.17 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  61.96 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  61.96 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  61.96 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  61.96 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  61.96 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  61.96 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  61.36 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  60.87 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  61.36 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  65.17 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  59.09 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  63.41 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  53.76 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  63.41 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  62.2 
 
 		 107 aa  105  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 107 aa  105  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  62.2 
 
 		 107 aa  105  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  63.41 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  63.41 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  61.63 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  57.47 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  63.41 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  59.14 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  61.8 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  60.24 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  58.82 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  57.95 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  54.65 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  57.95 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 120 aa  100  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  53.93 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  56.47 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  58.43 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  57.3 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  57.3 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  57.3 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  57.3 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  57.3 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  57.3 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  56.18 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  57.3 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  51.72 
 
 		 159 aa  97.4  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  54.55 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  52.94 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 119 aa  95.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  52.87 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  51.65 
 
 		 116 aa  94.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  51.11 
 
 		 116 aa  94.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  59.3 
 
 		 144 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  59.3 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  59.3 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  59.3 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  59.3 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  58.62 
 
 		 206 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  51.16 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  58.62 
 
 		 220 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  57.65 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  50.57 
 
 		 117 aa  94  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  58.14 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  52.75 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  50.63 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  50 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  53.26 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  48.24 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  52.33 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  56.47 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  47.83 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  51.9 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  53.57 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>