More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3457 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  100 
 
 
226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 
219 aa  198  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  43.13 
 
 
222 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 
223 aa  154  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  40.19 
 
 
219 aa  144  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
234 aa  142  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  38.29 
 
 
246 aa  138  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
228 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 
229 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
230 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  36.95 
 
 
213 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  45.24 
 
 
213 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
210 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  36.65 
 
 
239 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  48.51 
 
 
212 aa  95.5  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
215 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 
140 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
130 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  32.04 
 
 
236 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  39.18 
 
 
110 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
112 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  37.76 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  38.78 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  37.76 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  37.76 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  37.76 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  32.69 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
143 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 
166 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 
137 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  25.44 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  46.74 
 
 
150 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  32.46 
 
 
119 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1349  transcriptional regulator, HxlR family  32.54 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.124535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  40.4 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  41.59 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
152 aa  72  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  41.3 
 
 
148 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  38.78 
 
 
114 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 
149 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  44.33 
 
 
113 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  38.78 
 
 
114 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
114 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
116 aa  70.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  32.46 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  32.28 
 
 
129 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  39.78 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  35.51 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  33.68 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  39.22 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  35.29 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  40.82 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  38.26 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  40.82 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  35.05 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>