More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1971 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  278  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  70.45 
 
 		 135 aa  200  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  62.5 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  60.71 
 
 		 138 aa  153  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  59.5 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  52.99 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  55.37 
 
 		 163 aa  141  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  55.37 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  53.1 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  48.82 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  51.75 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  59.79 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  52.73 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  49.54 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  49.09 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 180 aa  116  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  50.94 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  48.11 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  47.66 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  50.47 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  50.44 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  48.04 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03748  transcriptional regulatory protein  52.88 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  44.74 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  45.87 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  45.76 
 
 		 125 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  46.85 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  50.47 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  41.53 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  52.83 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  45.19 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  44.66 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  44.23 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  44.66 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  44.23 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  44.66 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  49.02 
 
 		 135 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  48.21 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  49.53 
 
 		 135 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  47.32 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  48.67 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  47.22 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  48.15 
 
 		 146 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  49.48 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  48.15 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  40.83 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  47.12 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  46.3 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  47.96 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  47.12 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  45.69 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  48.39 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  47.92 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  47.92 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  48.35 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3367  transcriptional regulator, HxlR family  41.46 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  43.01 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>