More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2977 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 170 aa  342  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  72.56 
 
 		 164 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  64.84 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  60.8 
 
 		 135 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  59.09 
 
 		 163 aa  158  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  52.7 
 
 		 163 aa  158  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  56.1 
 
 		 144 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  54.17 
 
 		 144 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  72.16 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  56.14 
 
 		 135 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  57.89 
 
 		 138 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  62.04 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  54.87 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 134 aa  132  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  53.7 
 
 		 128 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  54.13 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  55.86 
 
 		 135 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  51.24 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  53.64 
 
 		 135 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  53.64 
 
 		 135 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03748  transcriptional regulatory protein  55.66 
 
 		 120 aa  117  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  51.79 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  47.22 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  54.9 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 127 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 151 aa  114  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  51.24 
 
 		 160 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  54.29 
 
 		 125 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  51.85 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  43.38 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 137 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  48.04 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  43.8 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  43.8 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  45.45 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  45.79 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  45.54 
 
 		 134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 122 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 131 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  46.55 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 132 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 146 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  45.28 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  50.48 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  44.25 
 
 		 126 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  46.79 
 
 		 128 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  43.8 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  45.19 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  53 
 
 		 108 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  39.83 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  47.12 
 
 		 128 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  43.93 
 
 		 124 aa  104  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  49.06 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  46.73 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  48.6 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  50.98 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 125 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 135 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  37.61 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  47.17 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 101 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  48.6 
 
 		 119 aa  101  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  41.9 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  47.71 
 
 		 272 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1768  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  45.95 
 
 		 131 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 136 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 122 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 133 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 130 aa  99.8  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0264  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 		 127 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  38.74 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  38.89 
 
 		 142 aa  99  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  47.32 
 
 		 130 aa  99  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 148 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 159 aa  99  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  38.74 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 		 129 aa  98.2  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  45.63 
 
 		 111 aa  98.2  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>