More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2994 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  100 
 
 		 130 aa  270  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  89.92 
 
 		 130 aa  241  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  49.51 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  45.87 
 
 		 144 aa  113  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  44.72 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  48.04 
 
 		 135 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  43.12 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  46.36 
 
 		 272 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  45.71 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  44.25 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  37.7 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  45.63 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  42.73 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  42.45 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  40.95 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 180 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 135 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  44.55 
 
 		 135 aa  100  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 		 170 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  46.6 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  42.72 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  40.52 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5865  HxlR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.480533  normal  0.03101 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 135 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  39.32 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  39.32 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  42.45 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2221  transcriptional regulator, HxlR family  43.12 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  42.31 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  49.41 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  39.47 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  39.81 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  39.81 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  40.54 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  45.56 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 175 aa  92.8  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  47.78 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  35.51 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  38.39 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6037  HxlR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.929576  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 128 aa  90.1  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  37.39 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  49.41 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  39.29 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  40.19 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  35.16 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  39.09 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  35.65 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  35.45 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  37.17 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  35.65 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  35.65 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>