More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2508 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  84.97 
 
 		 154 aa  259  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  63.72 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  63.72 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  63.72 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  63.72 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  63.72 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  63.72 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  63.72 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  63.72 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  62.83 
 
 		 126 aa  160  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  66.97 
 
 		 133 aa  159  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  64.6 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  63.72 
 
 		 135 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  63.72 
 
 		 133 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  63.72 
 
 		 133 aa  156  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  62.5 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  60 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  64.55 
 
 		 159 aa  153  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  63.06 
 
 		 144 aa  151  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  55.12 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  60 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  57.85 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  53.78 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  56.88 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  52.5 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2415  transcriptional regulator, HxlR family  54.37 
 
 		 144 aa  113  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681664 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  49.53 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  42.74 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0420  helix-turn-helix, HxlR type  51.33 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  47.32 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  39.84 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  37.82 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  45.37 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  45.13 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0863  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208963  normal  0.676948 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  39.52 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  40.32 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  36.43 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  43.12 
 
 		 126 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  43.12 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  40.18 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  42.48 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3340  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  38.13 
 
 		 164 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  40.54 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3263  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 163 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  42.72 
 
 		 163 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  41.23 
 
 		 135 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  43.69 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  37.29 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  39.17 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2563  putative transcriptional regulator  40.71 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  38.05 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3367  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  32.79 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  43.12 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  40.37 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  42.48 
 
 		 134 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  38.83 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  34.82 
 
 		 133 aa  91.3  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  37.19 
 
 		 135 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  37.19 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  38.79 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4674  transcriptional regulator, HxlR family  50.57 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.591353 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>