More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2563 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2563  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1078  hypothetical protein  53.38 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4573  HxlR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0516521 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0183  HxlR family transcriptional regulator  60.16 
 
 		 140 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4835  HxlR family transcriptional regulator  57.48 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.558288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6809  HxlR family transcriptional regulator  57.48 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2407  transcriptional regulator  50.52 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2746  transcriptional regulator, HxlR family  41.88 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  40.71 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  40.16 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5164  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  40.91 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  37.39 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  44 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  40.78 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2221  transcriptional regulator, HxlR family  32.2 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  38.52 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  41.51 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0264  HxlR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  36.29 
 
 		 159 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  41 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  39.22 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  39.13 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  43.33 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  43.33 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  38.06 
 
 		 272 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  38.68 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  42.57 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5865  HxlR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.480533  normal  0.03101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  35.92 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  38.79 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  38 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  40.38 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2415  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681664 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  40.19 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  44.71 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  36.7 
 
 		 133 aa  76.6  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  36.7 
 
 		 133 aa  76.6  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  34.48 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  38.61 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>