More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1078 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1078  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  300  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4573  HxlR family transcriptional regulator  60.16 
 
 		 137 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0516521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4835  HxlR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 137 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.558288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0183  HxlR family transcriptional regulator  60.8 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6809  HxlR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2563  putative transcriptional regulator  53.38 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2407  transcriptional regulator  57.14 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 133 aa  94.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2746  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  40.19 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 180 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 136 aa  88.6  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  35.51 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  41.88 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5164  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  41.75 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0264  HxlR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  36.03 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  36.03 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  42.16 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  38.68 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  39.32 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  39.02 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  39.25 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  41.76 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  41.35 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  39.02 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  35.61 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  40.19 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  38.89 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  44.66 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 135 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 128 aa  76.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  41.58 
 
 		 135 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  37.25 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  45.57 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  38.61 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  36.89 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1318  transcriptional regulator, HxlR family  41.07 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  40.57 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  37.39 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03748  transcriptional regulatory protein  39.81 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  39.5 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  37.61 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2221  transcriptional regulator, HxlR family  32.28 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  46.07 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  32.77 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  50.62 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  40.16 
 
 		 272 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3041  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>