More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2407 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2407  transcriptional regulator  100 
 
 		 114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0183  HxlR family transcriptional regulator  70.21 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4835  HxlR family transcriptional regulator  69.15 
 
 		 137 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.558288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6809  HxlR family transcriptional regulator  69.15 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4573  HxlR family transcriptional regulator  69.15 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0516521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1078  hypothetical protein  57.14 
 
 		 147 aa  114  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2563  putative transcriptional regulator  50.52 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5164  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2746  transcriptional regulator, HxlR family  49.44 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0264  HxlR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 		 144 aa  84.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  48.31 
 
 		 160 aa  84.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 		 130 aa  84.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  51.25 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  46.07 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  47.62 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  40.48 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  48.19 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  48.68 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  48.19 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  46.07 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  44.23 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  45.05 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  45.45 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  41.76 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  41.57 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  38.64 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  45.35 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  45.57 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  42.68 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  47.56 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  47.56 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  46.25 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  44.16 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  49.32 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  50.59 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  39.33 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2221  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  46.34 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03748  transcriptional regulatory protein  43.9 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  41.86 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  45.24 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  43.37 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  40.66 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5865  HxlR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.480533  normal  0.03101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  43.9 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  37.8 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  46.91 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  43.21 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  43.01 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  47.5 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  38.2 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  44.59 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  42.53 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  44.05 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1717  transcriptional regulator, putative  44.78 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 		 235 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1881  HxlR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1531  transcriptional regulator, putative  44.78 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>