More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0324 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 
272 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  76.64 
 
 
148 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  68.03 
 
 
151 aa  189  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  61.82 
 
 
137 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  61.02 
 
 
160 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  69 
 
 
125 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  60.38 
 
 
134 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  54.78 
 
 
137 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  59.66 
 
 
180 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  55.37 
 
 
150 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  54.13 
 
 
137 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  59.05 
 
 
133 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  52.63 
 
 
168 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  50.46 
 
 
148 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  50.46 
 
 
174 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  50.46 
 
 
174 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  52.73 
 
 
141 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  50.76 
 
 
135 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  50.76 
 
 
135 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  50.46 
 
 
154 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  49.54 
 
 
171 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  58.49 
 
 
126 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  50.46 
 
 
146 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  49.54 
 
 
154 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  55.86 
 
 
135 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  50.93 
 
 
146 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  52.5 
 
 
135 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  49.19 
 
 
125 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  47.5 
 
 
144 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  51.4 
 
 
130 aa  116  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  50.46 
 
 
154 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  49.07 
 
 
134 aa  115  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  51.3 
 
 
159 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  48.72 
 
 
132 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  56.25 
 
 
136 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  52.34 
 
 
135 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  50.46 
 
 
124 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  51.43 
 
 
131 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  53.92 
 
 
135 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2221  transcriptional regulator, HxlR family  53.77 
 
 
152 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  55.24 
 
 
132 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5865  HxlR family transcriptional regulator  55.45 
 
 
149 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.480533  normal  0.03101 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  46.96 
 
 
139 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  49.09 
 
 
126 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  48.62 
 
 
129 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  46.08 
 
 
146 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  45.28 
 
 
132 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  44.35 
 
 
127 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  46.36 
 
 
130 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  48.7 
 
 
131 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
156 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  46.36 
 
 
130 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  49.53 
 
 
163 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  52.34 
 
 
144 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  49.53 
 
 
163 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  46.3 
 
 
155 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 
175 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
137 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  48.11 
 
 
128 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  45.95 
 
 
127 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
126 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
144 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
144 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
122 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5164  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 
145 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 
128 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  48.11 
 
 
144 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  45.54 
 
 
144 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  47.75 
 
 
128 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  47.62 
 
 
134 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
131 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
108 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
136 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  49.04 
 
 
122 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  49.55 
 
 
125 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  43.8 
 
 
124 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  48.18 
 
 
130 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  48.6 
 
 
164 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  46.02 
 
 
144 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  50.94 
 
 
124 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  47.71 
 
 
170 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
121 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  43.81 
 
 
133 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
135 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  43.81 
 
 
133 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  54.35 
 
 
157 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  44.27 
 
 
154 aa  99.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  46.09 
 
 
135 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
159 aa  99.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 
128 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  46.79 
 
 
121 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  48.57 
 
 
111 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 
149 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  43.93 
 
 
126 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  45.61 
 
 
128 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 
128 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  42.2 
 
 
134 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  42.59 
 
 
138 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  40.87 
 
 
125 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 
132 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.785405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>