More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0476 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  261  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  99.21 
 
 
126 aa  259  8e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
121 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  49.56 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  41.96 
 
 
127 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  41.53 
 
 
125 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  45.22 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  43.1 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  44.95 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  42.48 
 
 
125 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2460  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
148 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  48.6 
 
 
146 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  47.32 
 
 
125 aa  105  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  44.95 
 
 
135 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 
133 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
135 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 
133 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
154 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
154 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  41.03 
 
 
146 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
174 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  43.86 
 
 
144 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
174 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  41.03 
 
 
171 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  41.9 
 
 
126 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 
126 aa  103  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 
133 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  41.9 
 
 
126 aa  103  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
126 aa  103  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  41.9 
 
 
126 aa  103  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  41.9 
 
 
126 aa  103  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  41.9 
 
 
126 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  41.9 
 
 
126 aa  103  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
134 aa  103  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 
144 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  41.53 
 
 
154 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  40.95 
 
 
126 aa  102  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  46.79 
 
 
125 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
137 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 
138 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  43.12 
 
 
142 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  41.44 
 
 
129 aa  101  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  39.29 
 
 
132 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  42.15 
 
 
150 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  38.74 
 
 
144 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  43.12 
 
 
154 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  45.28 
 
 
148 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
130 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  50 
 
 
137 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  39.13 
 
 
124 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  41.07 
 
 
136 aa  98.6  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  43.93 
 
 
272 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
121 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  40.54 
 
 
131 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  42.73 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  39.64 
 
 
146 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  41.28 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  46.3 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  41.88 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  40.18 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 
138 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  39.81 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  44.07 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  47 
 
 
111 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
148 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  37.17 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  42.98 
 
 
128 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  47.96 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  41.35 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
108 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2415  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 
144 aa  90.5  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0681664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
124 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  40.98 
 
 
126 aa  90.1  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
135 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  45.1 
 
 
135 aa  90.1  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  44.66 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  43.56 
 
 
131 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 
170 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
144 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  41.03 
 
 
135 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 
135 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
180 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
144 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  39.52 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  38.98 
 
 
154 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
137 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>