More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2415 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2415  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 144 aa  280  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681664 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  55.45 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0420  helix-turn-helix, HxlR type  60.19 
 
 		 115 aa  120  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  47.97 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  49.56 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  49.56 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  55.34 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  47.9 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  47.9 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  47.9 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  47.9 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  47.9 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  47.9 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  47.9 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  47.9 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  53.4 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 140 aa  113  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  54.37 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  49.15 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  49.51 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  53.47 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  52.48 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 174 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 174 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  42.25 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  47.37 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 154 aa  103  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  42.52 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  40.16 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  41.46 
 
 		 154 aa  99.4  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  42.65 
 
 		 170 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  41.32 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  44.72 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  45.37 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  42.06 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 180 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  45.3 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  42.06 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  38.94 
 
 		 131 aa  90.9  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  44.25 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  40.8 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3367  transcriptional regulator, HxlR family  41.88 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4674  transcriptional regulator, HxlR family  51.14 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.591353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  42.4 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  38.6 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  40.62 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3340  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  34.17 
 
 		 125 aa  87  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  41.12 
 
 		 272 aa  85.9  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  38.21 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  38.76 
 
 		 135 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  38.33 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3957  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0863  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208963  normal  0.676948 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  35.59 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1349  transcriptional regulator, HxlR family  37.04 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  43.22 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2460  transcriptional regulator, HxlR family  42.28 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2221  transcriptional regulator, HxlR family  38.33 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  42.57 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  43.52 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  31.93 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  44.79 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>