More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0420 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0420  helix-turn-helix, HxlR type  100 
 
 		 115 aa  228  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2415  transcriptional regulator, HxlR family  62.38 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  62.11 
 
 		 159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  52.88 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  56.31 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  56 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  55 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  55 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  55 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  51.35 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  54.9 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  51.33 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  52.21 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  54 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  55.21 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  54.26 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  54.26 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  54.26 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  54.26 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  54.26 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  54.26 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  56.99 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  54.26 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  54.35 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  54.17 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  51.61 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  46.39 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  43.56 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  49.45 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  50 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  54.65 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  54.55 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  44.44 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  44.44 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4674  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.591353 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  45.36 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  44.9 
 
 		 128 aa  84.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0863  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208963  normal  0.676948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 132 aa  83.6  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  42.7 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  49 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  45.36 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3340  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  43.62 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3367  transcriptional regulator, HxlR family  50.56 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  42.71 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  43.88 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  47 
 
 		 272 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  44.21 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  42.86 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  46.32 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  42.86 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  39.36 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  41.41 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>