More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4674 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4674  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 133 aa  272  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.591353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3340  transcriptional regulator, HxlR family  69.49 
 
 		 125 aa  175  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3367  transcriptional regulator, HxlR family  60.44 
 
 		 133 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  46.22 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  55.06 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  51.61 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  51.61 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  51.61 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  51.61 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  51.61 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  51.61 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  51.61 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  42.34 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  50.54 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  51.69 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  48.89 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  48.89 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3263  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2915  transcriptional regulator, HxlR family  51.14 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  48.39 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  45.74 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 146 aa  90.5  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  50.57 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  50.57 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  46.81 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  51.81 
 
 		 128 aa  88.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2415  transcriptional regulator, HxlR family  51.14 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  47.25 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0420  helix-turn-helix, HxlR type  50.54 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 125 aa  85.9  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0863  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208963  normal  0.676948 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4579  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  44.58 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  41.57 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  45.98 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2460  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  43.82 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  35.96 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  35.96 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  44.87 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  42.68 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  36.51 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  42.39 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  35.4 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  34.41 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  33.7 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  38.53 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  38.53 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  42.05 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  38.2 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  41.11 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 157 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>