More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3263 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3263  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 112 aa  226  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  49.02 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  44.23 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  43.27 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 159 aa  93.6  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  39.81 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  36.04 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  39.81 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4674  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.591353 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  48.28 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0863  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208963  normal  0.676948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  47.67 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3340  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  39.6 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  44.44 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  39.6 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  43.01 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  41.35 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  41.35 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2415  transcriptional regulator, HxlR family  44.71 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681664 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  38.46 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  38.68 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  39.42 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2460  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  35.85 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  35.85 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  37.5 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  43.62 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0420  helix-turn-helix, HxlR type  43.82 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  43.62 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  36.19 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  49.4 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  39.08 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  45.78 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  35.78 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  47.44 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2915  transcriptional regulator, HxlR family  42.05 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3367  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  42.55 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  40 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  41.11 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  38.64 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  42.53 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>