More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2915 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2915  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 146 aa  286  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  46.73 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 126 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  52 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  48.51 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  49 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  42.62 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 140 aa  97.1  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 134 aa  96.7  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3367  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 		 133 aa  96.7  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  42.48 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  46 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3340  transcriptional regulator, HxlR family  51.69 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  52.81 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  43.88 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 175 aa  94.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  42.61 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  47.96 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4674  transcriptional regulator, HxlR family  51.14 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.591353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0863  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208963  normal  0.676948 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  39.66 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 129 aa  90.5  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 157 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  41.74 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  40.98 
 
 		 168 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  41.74 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  40.74 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  44.94 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  39.25 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  39.25 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 137 aa  87.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  44 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  42.86 
 
 		 272 aa  87.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  45.56 
 
 		 135 aa  87.4  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  43.96 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 148 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  45.45 
 
 		 171 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  45.45 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6037  HxlR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.929576  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  44.44 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  45.88 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  37.8 
 
 		 130 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  39.83 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  38.26 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 133 aa  84.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  46.67 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  46.74 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  47.67 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  36.22 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  39.8 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  39.62 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  43.96 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>