More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0026 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  61.61 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0863  transcriptional regulator, HxlR family  56.25 
 
 		 148 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208963  normal  0.676948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  52.07 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  57.84 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  57.84 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  57.84 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  57.84 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  57.84 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  57.84 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  57.84 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  57.84 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 137 aa  124  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  52.78 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  53.7 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  46.96 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  51.79 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  45.97 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  54.21 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  51.92 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3367  transcriptional regulator, HxlR family  60.64 
 
 		 133 aa  118  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 140 aa  115  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  44.27 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  42.45 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  44.17 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  53.68 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  43.31 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  45.95 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  44.25 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  47.86 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  45.95 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  39.34 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  47.71 
 
 		 170 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3340  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2415  transcriptional regulator, HxlR family  45.37 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  46.43 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3263  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  42.48 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2915  transcriptional regulator, HxlR family  52 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  44.25 
 
 		 133 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  41.23 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  41.91 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4674  transcriptional regulator, HxlR family  42.34 
 
 		 133 aa  97.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.591353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  40.18 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 135 aa  97.1  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  42.73 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  47.17 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  39.82 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  40.18 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 174 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 174 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  36.75 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  38.3 
 
 		 272 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  43.4 
 
 		 163 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 138 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  40.18 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  38.05 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  41.82 
 
 		 138 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  41.82 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  38.6 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 124 aa  91.3  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  37.38 
 
 		 133 aa  91.3  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  41.9 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  39.25 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  41.96 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  38.68 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>