More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0313 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  246  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  68.97 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  68.14 
 
 		 125 aa  167  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  61.86 
 
 		 127 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  63.16 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  59.17 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  59.17 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  60.18 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  59.17 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 125 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  59.29 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  55.26 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  54.87 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  49.56 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  56.25 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  54.21 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  44.44 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  44.44 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  50.42 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 180 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  48.18 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  51.28 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  52.94 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 122 aa  117  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  48.62 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  48.25 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  46.85 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  47.17 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  47.17 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  52.34 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  49.56 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  47.17 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 170 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  52.34 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  51.38 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  46.73 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  49.53 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  47.71 
 
 		 164 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  45.3 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  46.23 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  49.02 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  49.56 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  49.5 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  49.5 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  49.5 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  47.37 
 
 		 144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  49.15 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  46.02 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  47.62 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  45.87 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  49.53 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 135 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  42.2 
 
 		 133 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  44.25 
 
 		 144 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  44.35 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 150 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  51.49 
 
 		 134 aa  105  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  46.96 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  43.36 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 157 aa  103  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  40.71 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6037  HxlR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 130 aa  103  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.929576  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  42.59 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  40.52 
 
 		 175 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1318  transcriptional regulator, HxlR family  52.03 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  44.95 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>