More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1440 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  290  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  72.31 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  70.73 
 
 		 133 aa  180  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  72.88 
 
 		 128 aa  176  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  68.64 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  68.64 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  68.64 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  68.64 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  68.64 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  68.64 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  68.64 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  68.64 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  68.64 
 
 		 126 aa  174  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  68.18 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  66.36 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  60 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  63.79 
 
 		 154 aa  153  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  56.9 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  62.61 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  62.61 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  62.61 
 
 		 135 aa  147  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  63.41 
 
 		 144 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  58.72 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  62.26 
 
 		 121 aa  133  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  53.45 
 
 		 128 aa  127  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  116  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  53.92 
 
 		 153 aa  115  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  53.15 
 
 		 154 aa  115  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  53.21 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0863  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208963  normal  0.676948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2415  transcriptional regulator, HxlR family  51.89 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  46.9 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3340  transcriptional regulator, HxlR family  51.92 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  41.46 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  47.66 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3367  transcriptional regulator, HxlR family  51 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  44.14 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  38.66 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0420  helix-turn-helix, HxlR type  54.26 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  41.32 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  39.81 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 130 aa  94.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  38.89 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  39.17 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  41.44 
 
 		 171 aa  94  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  39.81 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  37.6 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  43.06 
 
 		 168 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 174 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 174 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  39.01 
 
 		 154 aa  93.6  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  49.49 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3263  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2915  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  41.74 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  44.95 
 
 		 163 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  44.95 
 
 		 163 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  44.66 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  44.76 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  44.66 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4674  transcriptional regulator, HxlR family  49.47 
 
 		 133 aa  90.5  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.591353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  39.64 
 
 		 128 aa  90.1  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  41.28 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  42.16 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  44.95 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 180 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1825  transcriptional regulator, HxlR family  38.33 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  46.94 
 
 		 170 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  42.42 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>