More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1825 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1825  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 119 aa  243  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0879  transcriptional regulator, HxlR family  67 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.40376  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  55.86 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1881  HxlR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2019  putative transcriptional regulator  54.46 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7647  transcriptional regulator, HxlR family  52.73 
 
 		 123 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  51.69 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 135 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  40.54 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  43.75 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  47.32 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  43.4 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  48.98 
 
 		 135 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  46.94 
 
 		 130 aa  98.2  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  47.62 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  45.37 
 
 		 159 aa  97.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  42.06 
 
 		 163 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  47.47 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 133 aa  93.6  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 160 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  40.54 
 
 		 132 aa  92  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  37.72 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  36.13 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  44.66 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  43.14 
 
 		 111 aa  90.5  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 131 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  39.64 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  39.5 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  44.14 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  38.74 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  35.78 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  35.78 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  35.78 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  40.18 
 
 		 154 aa  87.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  38.98 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03748  transcriptional regulatory protein  43.88 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  37.72 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  35.96 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 174 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 174 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  38.26 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1318  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  38.32 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  39.81 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  39.81 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 133 aa  84.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  39.81 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  41.35 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  34.23 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>