More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2311 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 124 aa  249  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  56.14 
 
 		 132 aa  129  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  56.6 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  51.89 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  56.07 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  48.15 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  50.44 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  49.54 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  50.91 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  53.4 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 180 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  49.55 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  50.49 
 
 		 135 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  106  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  47.32 
 
 		 135 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  47.32 
 
 		 135 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 131 aa  107  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  47.32 
 
 		 135 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 132 aa  105  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  49.52 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  51.82 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  46.73 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  48.11 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  48.57 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  50 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  52.08 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  50.94 
 
 		 272 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  48.51 
 
 		 134 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  49.52 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  46.67 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 118 aa  99.4  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  48.04 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 117 aa  97.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  42.2 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 129 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  53.68 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  49.06 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  48.11 
 
 		 171 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 148 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  48.11 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 174 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 174 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  43.52 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  40.95 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  41.12 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  43.14 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5164  transcriptional regulator, HxlR family  42.73 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03748  transcriptional regulatory protein  47.12 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  42.57 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  42.16 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  42.57 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  42.57 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  44.23 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  42.57 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 163 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  48.94 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  42.16 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>