More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5429 on replicon NC_011880
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 149 aa  310  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  48.6 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  48.6 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  48.04 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  48.6 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 125 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  45.95 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  44.74 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  45.45 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  44.86 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  43.86 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  39.83 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  43.24 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  45.28 
 
 		 135 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  43.27 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  42.99 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 135 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  45.22 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  43.36 
 
 		 175 aa  103  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 180 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  36.67 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  37.7 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  42.48 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  39.47 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  37.61 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  41.53 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2915  transcriptional regulator, HxlR family  48.51 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  40.54 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1825  transcriptional regulator, HxlR family  40.54 
 
 		 119 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  42.45 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  45.54 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 159 aa  98.6  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  41.07 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  42.45 
 
 		 272 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  38.18 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  42.02 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1881  HxlR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 129 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  42.16 
 
 		 125 aa  97.1  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  42.99 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  40.18 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  40.18 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  38.05 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  41.28 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7647  transcriptional regulator, HxlR family  41.44 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  38.26 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  35.66 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  35.78 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  40.37 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>