More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0103 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
125 aa  259  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
125 aa  259  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  65.35 
 
 
101 aa  136  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
146 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  42.98 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 
149 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  40.17 
 
 
124 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
121 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  38.66 
 
 
144 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  40.87 
 
 
129 aa  101  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  37.61 
 
 
144 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
125 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  37.82 
 
 
125 aa  100  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  39.81 
 
 
144 aa  100  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 
134 aa  100  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  38.94 
 
 
132 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  38.74 
 
 
170 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  41.12 
 
 
168 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  37.39 
 
 
130 aa  99.4  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  40.35 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
154 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 
174 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 
174 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  40 
 
 
171 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 
133 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  39.47 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  40.87 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  43.12 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  40.95 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 
134 aa  95.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  38.39 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  36.61 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7647  transcriptional regulator, HxlR family  38.39 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3216  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 
132 aa  94  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 
135 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  37.4 
 
 
175 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  38.98 
 
 
135 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 
157 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  38.98 
 
 
135 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  35.51 
 
 
163 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  36.75 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  35.51 
 
 
163 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  37.39 
 
 
133 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3335  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  37.82 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  37.27 
 
 
138 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
148 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  36.04 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
141 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1881  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  37.17 
 
 
164 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
144 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
134 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
126 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  44.9 
 
 
114 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
114 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  44.9 
 
 
114 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0879  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.40376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  44.9 
 
 
114 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  44.9 
 
 
114 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  42.27 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
137 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  38.6 
 
 
119 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1318  transcriptional regulator, HxlR family  38.66 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  34.86 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
180 aa  87  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  35.96 
 
 
132 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
137 aa  87  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  36.07 
 
 
126 aa  86.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  37.39 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  43 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>