More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3216 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3216  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 132 aa  263  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3335  transcriptional regulator, HxlR family  72.17 
 
 		 117 aa  173  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  53.15 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  47.93 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 125 aa  90.5  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 101 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  40.18 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2460  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6637  HxlR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  44.95 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  43.64 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  46.39 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  41.58 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  44.04 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  35.19 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  43.12 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  43.62 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  45 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  44.55 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  48.91 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  44.23 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3780  transcriptional regulator protein  44.9 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.616266  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7647  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  39.22 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  44.55 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  38.95 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  39.25 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  38.95 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  47.37 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  47.06 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  41.88 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  37.89 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  38.39 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  43.36 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  37.89 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  37.89 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  37.89 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  37.89 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  37.89 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  37.89 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  47.25 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  38.61 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  37.07 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  42.39 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  42.39 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2415  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681664 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  42.39 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  42.2 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  36.15 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>