More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2460 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2460  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 121 aa  244  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  51.4 
 
 		 129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  44.04 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  44.04 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  49.04 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  44.83 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  48.6 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  45.19 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  45.63 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  42.61 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  46.08 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  48.48 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  44.21 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  46.08 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 174 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 174 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  46.08 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  46.08 
 
 		 171 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  44.55 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  48.98 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 175 aa  89.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  40.38 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  40.38 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  52.56 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  47 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 151 aa  87  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 138 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 159 aa  86.7  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  41.58 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  47.37 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  41.58 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  40.18 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3216  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 125 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 125 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  48.54 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  42.2 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0863  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208963  normal  0.676948 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  41.76 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  46.32 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  45.26 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1318  transcriptional regulator, HxlR family  44.35 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  42.55 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>