More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27270 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  57.25 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  61.61 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0863  transcriptional regulator, HxlR family  62.5 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208963  normal  0.676948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  53.28 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  55.96 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  55.96 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  55.96 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  55.96 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  55.96 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  55.96 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  55.96 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  54.39 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  55.05 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  54.13 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 144 aa  113  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  49.11 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3367  transcriptional regulator, HxlR family  51.85 
 
 		 133 aa  110  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  49.14 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  43.7 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  49.06 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  49.09 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  45.71 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  46.55 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  46.55 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  47.32 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  48.21 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  44.17 
 
 		 160 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  42.96 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  46.09 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2415  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  46.85 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  44.27 
 
 		 272 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  45.22 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  45.76 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  46.09 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 174 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 174 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  45.22 
 
 		 171 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  45.22 
 
 		 128 aa  97.8  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 134 aa  97.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  44.44 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2915  transcriptional regulator, HxlR family  52.81 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2460  transcriptional regulator, HxlR family  48.48 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  41.28 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  41.91 
 
 		 164 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  43.24 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  39.31 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  47.47 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  43.36 
 
 		 135 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 170 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 		 135 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  42.24 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  40.71 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  41.38 
 
 		 132 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  46.23 
 
 		 168 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  38.03 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  43.97 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 125 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4674  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.591353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0420  helix-turn-helix, HxlR type  50 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 180 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  38.98 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  38.98 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  36.18 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  39.82 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  40.68 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  36.28 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  43.93 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>