More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8738 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  100 
 
 
137 aa  279  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  65.42 
 
 
160 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  61.82 
 
 
272 aa  140  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  58.77 
 
 
151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  51.09 
 
 
180 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  58.41 
 
 
135 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  58.18 
 
 
133 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  52.85 
 
 
134 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  59.82 
 
 
148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  53.08 
 
 
135 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  55.08 
 
 
135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  57.02 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  57.02 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  52.34 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  50.81 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  52.14 
 
 
134 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  55.26 
 
 
122 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  51.33 
 
 
126 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  54.21 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  50 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  51.69 
 
 
132 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  49.07 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  45.04 
 
 
134 aa  117  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  48.62 
 
 
144 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
131 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  52.78 
 
 
168 aa  116  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
137 aa  115  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  48.72 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  46.73 
 
 
125 aa  115  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  48.62 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
136 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
137 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  59.18 
 
 
125 aa  114  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  50.91 
 
 
132 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  52.88 
 
 
108 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  50.98 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  49.09 
 
 
144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  48.65 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  48.7 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  47.66 
 
 
137 aa  111  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  47.71 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  49.53 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  48.15 
 
 
129 aa  110  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 
132 aa  110  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  50.46 
 
 
124 aa  110  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  44.95 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  50.49 
 
 
122 aa  110  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  44.04 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 
170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  48.11 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  46.3 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  39.83 
 
 
149 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  46.3 
 
 
135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  45.79 
 
 
164 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 
125 aa  107  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
148 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  42.98 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
127 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  46.3 
 
 
171 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  45.37 
 
 
146 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  45.61 
 
 
155 aa  107  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  50 
 
 
128 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
136 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  50.47 
 
 
125 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  50.98 
 
 
128 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  47.9 
 
 
128 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
154 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
174 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
174 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 
126 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
128 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
128 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
128 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
131 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
126 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  47.17 
 
 
127 aa  104  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  47.71 
 
 
175 aa  104  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  45.71 
 
 
130 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  54.74 
 
 
137 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
134 aa  104  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  43.64 
 
 
124 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 
124 aa  102  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  48.11 
 
 
128 aa  102  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
130 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
135 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  49.06 
 
 
124 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
121 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 
130 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 
132 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
144 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  42.98 
 
 
125 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  41.38 
 
 
134 aa  100  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  45.13 
 
 
135 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 
101 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 
138 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>