More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3172 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  99.42 
 
 		 171 aa  344  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  99.35 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  98.7 
 
 		 154 aa  307  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  98.64 
 
 		 148 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 146 aa  291  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  92.52 
 
 		 154 aa  277  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  60.17 
 
 		 124 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  52.9 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  53.28 
 
 		 127 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  60.36 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 121 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  60.66 
 
 		 128 aa  138  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  56.25 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  54.55 
 
 		 125 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 125 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  45.93 
 
 		 144 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  53.21 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  46.55 
 
 		 133 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  48.28 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  50.46 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  52.63 
 
 		 132 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  49.56 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  47.83 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  47.86 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 134 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 121 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  43.1 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  48.67 
 
 		 129 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 124 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  52.08 
 
 		 146 aa  112  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  44.62 
 
 		 144 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  111  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  44.25 
 
 		 128 aa  111  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 144 aa  111  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  45.08 
 
 		 160 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  51.43 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  43.8 
 
 		 170 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  47.71 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 125 aa  110  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 135 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  45.13 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  42.74 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  42.74 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  50.47 
 
 		 128 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  45.38 
 
 		 134 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  44.09 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  48.18 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  49.04 
 
 		 130 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6037  HxlR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 130 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.929576  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 135 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 135 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 131 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  45.37 
 
 		 137 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  50.52 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 144 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 134 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  38.52 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  41.03 
 
 		 126 aa  104  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 135 aa  104  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  44.19 
 
 		 128 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  47.12 
 
 		 150 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 108 aa  104  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  50 
 
 		 168 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  40.87 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  41.03 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  43.12 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  39.52 
 
 		 142 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  51.58 
 
 		 136 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 130 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  44.35 
 
 		 135 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 135 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  40.3 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  44.92 
 
 		 128 aa  101  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  47.27 
 
 		 128 aa  101  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 133 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 138 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  45.28 
 
 		 134 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1881  HxlR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.572162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>