More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2370 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  100 
 
 
121 aa  253  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  63.3 
 
 
125 aa  150  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  59.82 
 
 
130 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  58.59 
 
 
112 aa  133  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  58.51 
 
 
235 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  49.07 
 
 
118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  53.92 
 
 
117 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  53.06 
 
 
109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  51.46 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  51.46 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  51.46 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
126 aa  112  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  54.17 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  48.65 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  52.43 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  48.11 
 
 
115 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  54.26 
 
 
114 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  54.26 
 
 
114 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  54.26 
 
 
114 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  54.26 
 
 
114 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  48.11 
 
 
119 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  54.26 
 
 
114 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  49.56 
 
 
140 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  54.26 
 
 
114 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  48.21 
 
 
119 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  53.19 
 
 
114 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  44.83 
 
 
134 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  46.9 
 
 
119 aa  104  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  49.51 
 
 
116 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  53.19 
 
 
114 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  53.19 
 
 
114 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
122 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  44.66 
 
 
155 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  47.06 
 
 
115 aa  104  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  53.19 
 
 
114 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  53.19 
 
 
114 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  53.19 
 
 
114 aa  103  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  53.19 
 
 
115 aa  103  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  53.19 
 
 
114 aa  103  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  53.19 
 
 
114 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  45.19 
 
 
140 aa  103  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  47.52 
 
 
125 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
114 aa  100  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
114 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 
107 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 
137 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  45.26 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  44.34 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  42.31 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
120 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 
149 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  43.43 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 
119 aa  98.2  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 
130 aa  98.6  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5362  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 
116 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675608  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
116 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
120 aa  97.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  46.32 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  46.85 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 
133 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 
129 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  44.21 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  51.11 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  51.11 
 
 
108 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  44.21 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 
118 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 
117 aa  94  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  51.11 
 
 
108 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  47.96 
 
 
112 aa  94  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  44.35 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  44.35 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  44.35 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  44.35 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  44.35 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  44.35 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  47.87 
 
 
118 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  44.35 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  47.96 
 
 
112 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6156  transcriptional regulator protein-like protein  47.87 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747118  hitchhiker  0.000536988 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  49.44 
 
 
125 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.589379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>