More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5625 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  258  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0879  transcriptional regulator, HxlR family  69.91 
 
 		 126 aa  167  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.40376  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  63.87 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7647  transcriptional regulator, HxlR family  59.48 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1825  transcriptional regulator, HxlR family  62.73 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1881  HxlR family transcriptional regulator  57.63 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2019  putative transcriptional regulator  57.98 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 121 aa  123  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  50.47 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  48.18 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  51.92 
 
 		 135 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  51.92 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  53 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  51.4 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  54.64 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  41.74 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  40.98 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 174 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 174 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  47.17 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  48.45 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  46.09 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  40.68 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  49.48 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  46.67 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  46.36 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  48 
 
 		 119 aa  97.1  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  38.05 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  43.12 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  48.45 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  42.45 
 
 		 163 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  38.74 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  40.5 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  38.74 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  38.26 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  48.11 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  45 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  44.33 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  45.13 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  51.16 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 114 aa  91.7  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 134 aa  91.3  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 111 aa  91.3  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 128 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 128 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 128 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  36.04 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5865  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.480533  normal  0.03101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 133 aa  90.1  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  42 
 
 		 125 aa  90.5  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  36.04 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  43.3 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  36.04 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  36.04 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>