More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5164 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5164  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 145 aa  300  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  56.39 
 
 		 144 aa  153  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2221  transcriptional regulator, HxlR family  53.66 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  54.14 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  60.71 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5865  HxlR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.480533  normal  0.03101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  45.87 
 
 		 272 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 146 aa  104  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  43.2 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  47.12 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  48.57 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  45.95 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 174 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 174 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  47.62 
 
 		 171 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  47.62 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  45.63 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  47.52 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2746  transcriptional regulator, HxlR family  47.71 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 126 aa  95.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 114 aa  94.4  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  44.76 
 
 		 163 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  43.81 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 163 aa  94  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 180 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  42.99 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  42.99 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2407  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  42.99 
 
 		 135 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  46.73 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2563  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 108 aa  90.5  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 149 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  42.61 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  37.29 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 137 aa  90.5  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 155 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  38.53 
 
 		 128 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  42.73 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  43 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  42.24 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  38.68 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  44.33 
 
 		 128 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 150 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  43.81 
 
 		 136 aa  88.6  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  38.4 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  47.13 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  52.44 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  41.67 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1078  hypothetical protein  37.14 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4573  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0516521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4835  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.558288 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6037  HxlR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.929576  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0183  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  40.19 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  39.17 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>