More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4835 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4835  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  276  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.558288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6809  HxlR family transcriptional regulator  99.27 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0183  HxlR family transcriptional regulator  96.32 
 
 		 140 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4573  HxlR family transcriptional regulator  93.43 
 
 		 137 aa  235  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0516521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1078  hypothetical protein  58.59 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2563  putative transcriptional regulator  57.48 
 
 		 137 aa  160  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2407  transcriptional regulator  69.15 
 
 		 114 aa  143  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2746  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 119 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0264  HxlR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  35.09 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 144 aa  93.6  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5164  transcriptional regulator, HxlR family  38.68 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 180 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  45.28 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  43.69 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  42.99 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  35.16 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  46.08 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  46.08 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  38.68 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  40.19 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  45.1 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  36.92 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  40.54 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  36.07 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  41.35 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  40.37 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  36.67 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  38.05 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  41.76 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  66.07 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0241  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603552  normal  0.811077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  37.27 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  35.85 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  37.14 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3433  HxlR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.24132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  41.57 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25590  predicted transcriptional regulator  40.51 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.6055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1884  hypothetical protein  33.72 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.226318  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  64.29 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2221  transcriptional regulator, HxlR family  29.17 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5865  HxlR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.480533  normal  0.03101 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  36.7 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  38.64 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  37.4 
 
 		 272 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  39.24 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  35.92 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  37.37 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  35.45 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  31.53 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  28.36 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>