More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1884 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1884  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  257  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.226318  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0241  putative transcriptional regulator  45.6 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603552  normal  0.811077 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2995  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 115 aa  93.6  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0070  hypothetical protein  42.45 
 
 		 142 aa  93.2  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000421347 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  39 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  44.57 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  45.65 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0977  HxlR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 124 aa  87.4  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.363566  normal  0.0295243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  44.57 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2636  transcriptional regulator, HxlR family  40.57 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0214616  hitchhiker  0.00638714 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  44.57 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 112 aa  87.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 112 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  44.57 
 
 		 112 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2848  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 132 aa  84.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25590  predicted transcriptional regulator  40.21 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.6055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  43.01 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2415  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681664 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  40.95 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  40.95 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  40.95 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  41.9 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  41.35 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  41.9 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  41.9 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  41.9 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  41.9 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  41.9 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  39.05 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  41.94 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  38.05 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  41.94 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  37.86 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  37.86 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  35.92 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  33.03 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  41.94 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  42.22 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4573  HxlR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0516521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  39.36 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  34.04 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  34.31 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>