More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2995 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2995  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 115 aa  236  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2848  transcriptional regulator, HxlR family  79.82 
 
 		 109 aa  177  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1884  hypothetical protein  43.3 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.226318  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0070  hypothetical protein  38.95 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000421347 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2636  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0214616  hitchhiker  0.00638714 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  35.48 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  31.53 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0977  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.363566  normal  0.0295243 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0241  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603552  normal  0.811077 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  33.7 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1090  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25590  predicted transcriptional regulator  34.38 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.6055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  34.41 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  33.7 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0518  transcriptional regulator, HxlR family  30.61 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0952  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000720896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1918  HxlR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53463  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  32.04 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  37.04 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1511  HxlR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.353103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  34.41 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  45.07 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  34 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  35.16 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  35.8 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  35.8 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  35.8 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  31.68 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  33.04 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  34.78 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  35.8 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  31.68 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  31.25 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1717  transcriptional regulator, putative  34.41 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  28.72 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1531  transcriptional regulator, putative  34.41 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  32.61 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  30.11 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0609  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.822325  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  29.35 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  32.98 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  34.41 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  32.99 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  32.22 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  33.63 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  32.56 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  36.96 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  31.52 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  32.43 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2044  transcriptional regulator, HxlR family  36.47 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  34.94 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  31.91 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  32.14 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  38.57 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  34.94 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  34.48 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  30.21 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  30.11 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  26.88 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1884  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.189342  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  33 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  31.52 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>