More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1661 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 130 aa  269  8.000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  44.57 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  44.57 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  44.57 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  44.57 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0720  transcriptional regulator, HxlR family  37.19 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0201705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  45.65 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  44.57 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  43.62 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  37 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  37 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  37 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  37 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  37 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  37 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  36.27 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  37 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  37 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  34.51 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  36 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0368  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.149183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  37.08 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2498  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.288645  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 165 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  40.22 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  37.5 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  32.61 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  32.65 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1090  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  35.35 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1884  hypothetical protein  32.32 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.226318  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  31.76 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  32.04 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  35.05 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  32.29 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  34.07 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0952  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000720896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  34.95 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  29.47 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  34.07 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  33.7 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  33.68 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  28.32 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  33 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3451  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  36.96 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>