More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1884 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1884  transcriptional regulator  100 
 
 		 100 aa  207  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.189342  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0980  cinnamoyl ester hydrolase  45.36 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1136  transcriptional regulator  44.33 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000101059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  49.46 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0069  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.700237  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25580  predicted transcriptional regulator  43.68 
 
 		 93 aa  85.9  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25590  predicted transcriptional regulator  40.22 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.6055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0518  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0823  hypothetical protein  41.41 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1450  hypothetical protein  41.41 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1717  transcriptional regulator, putative  37.36 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1531  transcriptional regulator, putative  37.36 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  40.62 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  41.67 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  41.11 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  40.22 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  42.71 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0952  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000720896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  42.39 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  33.67 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  35.79 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  33.67 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  34.74 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  34.34 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  41.49 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  35.05 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  33.68 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  40.23 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  34.74 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1878  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0881  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  38.38 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3325  transcriptional regulator, HxlR family  40.23 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196974  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6156  transcriptional regulator protein-like protein  37.5 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747118  hitchhiker  0.000536988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  35.42 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  42.05 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  36.17 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4987  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>