More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0518 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0518  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
127 aa  259  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  69.92 
 
 
124 aa  187  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0952  transcriptional regulator  45.54 
 
 
130 aa  118  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000720896  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  42.99 
 
 
134 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  50.54 
 
 
105 aa  100  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  48.42 
 
 
107 aa  100  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  48.42 
 
 
107 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
125 aa  97.1  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  45.54 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  47.37 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  43.43 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  43.14 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  47.31 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  47.31 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  47.31 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 
112 aa  92  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 
109 aa  91.3  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
116 aa  89.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 
159 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  46.39 
 
 
116 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  39.05 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  41.18 
 
 
112 aa  87  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0069  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 
110 aa  87  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.700237  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  37.11 
 
 
112 aa  87  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1136  transcriptional regulator  45.24 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000101059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  40.21 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  43.75 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  43.75 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  43.75 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  43.75 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  43.75 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  43.75 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25590  predicted transcriptional regulator  38 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.6055  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 
128 aa  84.3  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1884  transcriptional regulator  37.23 
 
 
100 aa  84  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.189342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 
128 aa  84  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  45.05 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  45.05 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0980  cinnamoyl ester hydrolase  44.05 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  43.01 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  43.62 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  45.05 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 
126 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  36.28 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  40.78 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 
117 aa  82  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  41.49 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  40.78 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  43.96 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  40.78 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  40.78 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  40.78 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  43.96 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  40.78 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  43.96 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  43.96 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  40.78 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  40.78 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  43.96 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  42.55 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  42.55 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  42.55 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2498  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.288645  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  38.1 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  39.45 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  38.1 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>