More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1136 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1136  transcriptional regulator  100 
 
 		 108 aa  219  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000101059  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0980  cinnamoyl ester hydrolase  95.37 
 
 		 108 aa  210  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124883  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1884  transcriptional regulator  44.33 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.189342  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  45.56 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0518  transcriptional regulator, HxlR family  45.24 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25590  predicted transcriptional regulator  42.05 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.6055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  44.19 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  35.09 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  42.11 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  36.96 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  37.78 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  37.04 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  40.23 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  36.89 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 122 aa  76.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  34 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  41.86 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  39.33 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3325  transcriptional regulator, HxlR family  40.66 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196974  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  41.11 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  35.24 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1717  transcriptional regulator, putative  32.65 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25580  predicted transcriptional regulator  38.27 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1531  transcriptional regulator, putative  32.65 
 
 		 115 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0823  hypothetical protein  36.54 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1450  hypothetical protein  36.54 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4987  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0069  transcriptional regulator, HxlR family  34.29 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.700237  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  36.96 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  33.7 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  35.24 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  36.45 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  37.21 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0611  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  39.56 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  38.95 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  38.95 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  38.95 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  38.95 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  37.78 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>