More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3325 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3325  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 128 aa  261  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196974  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  86.29 
 
 		 131 aa  222  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  52.22 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  50.46 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  51.76 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  52.58 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  51.16 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 119 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  56.47 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  51.65 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  49.44 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  57.14 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  48.98 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  37.17 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  54.76 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  44.54 
 
 		 119 aa  94.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  51.16 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  55.42 
 
 		 121 aa  93.6  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  50.57 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4987  transcriptional regulator, HxlR family  48.86 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  46.51 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  51.14 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  46.59 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  51.65 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 133 aa  90.1  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  46.07 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  41.51 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  45 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  47.19 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  47.06 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  42.7 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  52.33 
 
 		 119 aa  90.1  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  43.82 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  44.71 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  42.7 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  42.7 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  45.92 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  48.31 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  45.88 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  53.49 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  51.11 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  47.06 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  47.06 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  45.88 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2498  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  46.34 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  47.67 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  48.31 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3472  transcriptional regulator  47.56 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  45.24 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  47.25 
 
 		 115 aa  86.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  44.83 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  48.04 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  49.44 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6156  transcriptional regulator protein-like protein  51.14 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747118  hitchhiker  0.000536988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  41.57 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  48.86 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  41.57 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  46.07 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  41.57 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  41.57 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  48.84 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  41.57 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  39.45 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  41.57 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  45.35 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  42.7 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  47.13 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>