More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1815 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2498  HxlR family transcriptional regulator  76.42 
 
 		 127 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  77.5 
 
 		 128 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  75 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  74.36 
 
 		 125 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  58.76 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0337  transcriptional regulator  55 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  52.04 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  51.02 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  54.08 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 116 aa  107  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  52.04 
 
 		 114 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  49.49 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  49.49 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  49.49 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  51.02 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  48.65 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  45.92 
 
 		 124 aa  103  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  45.92 
 
 		 124 aa  103  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  45.92 
 
 		 124 aa  103  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  48.48 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  45.92 
 
 		 124 aa  103  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  45.92 
 
 		 124 aa  103  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  45.92 
 
 		 124 aa  103  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  45.92 
 
 		 124 aa  103  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  45.92 
 
 		 124 aa  103  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  45.92 
 
 		 124 aa  103  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  49.49 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  48.98 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  48.98 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  48.98 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  48.98 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  48.98 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  48.98 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  56.18 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  50 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  47.92 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  47.57 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  50.56 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 180 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  49.49 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  48.48 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  47.42 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  47.42 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  48.31 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  52.69 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  52.69 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  52.69 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  49.44 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  48.86 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  41.88 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  49.5 
 
 		 119 aa  92  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  51.61 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  47.47 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  51.61 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  51.61 
 
 		 107 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  47.92 
 
 		 132 aa  90.1  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  51.16 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  49.52 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  51.69 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  48.86 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  46.07 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>