More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0348 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  71.7 
 
 
117 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  71.7 
 
 
117 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  71.7 
 
 
117 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  71.96 
 
 
121 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  70.09 
 
 
116 aa  166  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0337  transcriptional regulator  75.76 
 
 
128 aa  165  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  73.27 
 
 
119 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  70.59 
 
 
124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  68.32 
 
 
120 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1752  hypothetical protein  57.28 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0613542  normal  0.0473163 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  55.56 
 
 
107 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  56.12 
 
 
128 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2498  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
127 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  57.45 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  55.1 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  59.34 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  60.44 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  59.34 
 
 
114 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  59.34 
 
 
114 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  59.34 
 
 
114 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  59.34 
 
 
114 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  59.34 
 
 
114 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  59.34 
 
 
114 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  59.34 
 
 
114 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  53.19 
 
 
120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  58.24 
 
 
114 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  58.24 
 
 
114 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  59.34 
 
 
115 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  59.34 
 
 
114 aa  110  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  59.34 
 
 
114 aa  110  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  49.04 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  58.24 
 
 
114 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  53.85 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  51.52 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  54.84 
 
 
124 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  52.58 
 
 
127 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  48.11 
 
 
115 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  54.44 
 
 
126 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  54.44 
 
 
126 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  54.44 
 
 
126 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  55.43 
 
 
114 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  55.43 
 
 
114 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  54.44 
 
 
126 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  54.44 
 
 
126 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  54.44 
 
 
129 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  54.44 
 
 
126 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  54.44 
 
 
126 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  52.13 
 
 
122 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  56.04 
 
 
108 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  56.04 
 
 
108 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  56.04 
 
 
108 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 
151 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  51.02 
 
 
119 aa  103  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  46.67 
 
 
125 aa  103  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  54.35 
 
 
114 aa  103  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 
155 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  54.35 
 
 
113 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  54.35 
 
 
113 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  54.35 
 
 
113 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 
129 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  54.44 
 
 
110 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  54.95 
 
 
108 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 
134 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
114 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  49.53 
 
 
139 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  54.95 
 
 
108 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 
132 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  50 
 
 
130 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
126 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  55.56 
 
 
108 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  54.44 
 
 
159 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  50 
 
 
141 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  54.95 
 
 
220 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  49.48 
 
 
159 aa  100  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  54.95 
 
 
206 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 
117 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  54.95 
 
 
144 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  50.55 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  53.26 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  54.95 
 
 
111 aa  99.4  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  54.95 
 
 
144 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  54.95 
 
 
144 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  54.95 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  54.95 
 
 
144 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  51.09 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  50.55 
 
 
123 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  47.25 
 
 
113 aa  97.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  51.65 
 
 
119 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  51.65 
 
 
115 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  49.45 
 
 
117 aa  97.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  48.04 
 
 
121 aa  97.8  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 
116 aa  97.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  52.75 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  51.06 
 
 
119 aa  97.1  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  51.11 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  51.11 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  47.87 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>