More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3472 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3472  transcriptional regulator  100 
 
 		 136 aa  271  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  44.44 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3325  transcriptional regulator, HxlR family  47.56 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196974  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  42.27 
 
 		 140 aa  87  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0337  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  39.78 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  45.35 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  42.22 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  39.56 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  37.11 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0892  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  42.22 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  43.02 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0881  transcriptional regulator, HxlR family  40.66 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6229  HxlR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6398  HxlR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6631  HxlR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.932723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  40.59 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  43.02 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  40.59 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  40.59 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  43.02 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  43.02 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  40.59 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  43.02 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  40.59 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  40.59 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  38.46 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  43.02 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  40.59 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  43.02 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  41.76 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  38.46 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  43.02 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2633  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895266  normal  0.749568 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  40.59 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  40.59 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  40.66 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  39.81 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  45.24 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  35.05 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0879  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.399174  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0113  HxlR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742523  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  34.78 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  39.56 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4987  transcriptional regulator, HxlR family  34.55 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  41.57 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  41.57 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  41.57 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3102  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>