More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3848 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  246  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0879  transcriptional regulator, HxlR family  84.03 
 
 		 119 aa  210  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.399174  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0881  transcriptional regulator, HxlR family  78.81 
 
 		 122 aa  197  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2633  transcriptional regulator, HxlR family  78.45 
 
 		 121 aa  192  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895266  normal  0.749568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  75.65 
 
 		 125 aa  186  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4263  transcriptional regulator, HxlR family  57.52 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.042978  normal  0.290046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  55.24 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5687  transcriptional regulator, HxlR family  48.67 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.643264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2531  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6703  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 134 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  44.21 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  40.19 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  39.29 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  39.29 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  39.29 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  39.29 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  39.29 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  40.57 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  40.57 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  36.52 
 
 		 129 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  37.5 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  45.98 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  45.05 
 
 		 123 aa  88.6  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1782  transcriptional regulator, HxlR family  39.05 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  36 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  44.09 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  44.83 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  44.09 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 116 aa  87.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  43.68 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  43.16 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  43.68 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 160 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  43.16 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  43.16 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  43.16 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  43.16 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  35 
 
 		 107 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  43.16 
 
 		 220 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  43.16 
 
 		 206 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  39.05 
 
 		 141 aa  87  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  48.24 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  43.68 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  43.68 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  43.68 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  43.68 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  48.24 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  43.68 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  45.16 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2483  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0347086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  43.68 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  34 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  37.27 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  34 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  43.68 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  43.68 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  41.05 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  42.11 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  44.09 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  39.39 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 159 aa  84  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>